Bueno, si la Base de Datos se encuentra en un servidor lo que yo te recomiendo es construir un query string para la conexión. Por ejemplo, si quieres traer de la Base de Datos todos los nombres de una tabla, construye un query y se lo pasas a un servelt y el servelt realizará la conexión directa con la Base de Datos. Desde la aplicación J2ME creo que directamente no podrás hacerlo (al menos yo no sé cómo), entonces la conexión la va a realizar una página .jsp, .php, .asp... lo que ás te guste y desde la aplicación J2ME lo que vas a hacer es pedirle las cosas a esa página.
Espero que te sirva de algo y me hayas entendido.

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